由于磨骨颧骨手术仅仅是少颧骨的部分体积，没有改变颧骨的立体结构，也没有改变颧骨或颧弓的位置，只能改善45度视角方向的脸部弧度，而脸型两侧的宽度则没有改变，视觉效果不是很大。而且由于颧骨本身结构的限制，磨骨瘦脸手术少颧骨的体积也非常有限，因此该手术适用范围较窄。
1、磨骨颧骨最严重的副作用就是面神经颞支损伤，导致眉下垂，呈‘悲伤面容’。这些副作用都将极大地影响求美者的生活质量。
2、面颈部皮肤切口入路的手术还有一个非常危险的并发症-神经损伤。
3、口外入路的下颌角肥大(方脸改瓜子脸)手术可能会损伤面神经下颌缘支。
4、导致颈阔肌的中上部分、降口角肌和降唇肌瘫痪，面部变形(特别是面部有表情动作如微笑等时)和不对称。
磨颧骨适用于单纯颧骨局部比较高而颧弓不突出也不高者，由于颧弓位于面部的侧方和颧弓本身厚度所限，对于高颧弓者不适于行磨骨。颧骨下角对于维持人体面部正常形态起有非常重要的作用，所以磨颧骨时禁忌将颧骨下角全部磨除。根据临床观察一般单纯磨颧骨术后效果往往不理想，所以目前水平较高的单位或医院多数比较少采用单纯磨颧骨的手术方法。